И так, начинаем со второго сезона.
Наруто после долгой тренеровки Джирайи которая длилась 2 года, вернулся в Коноху и обнаружил что он единственный геннин из своей возрастной группы, Сакура как оказалось тоже времени даром не теряла и обучалась у Цунаде-самы. Жизнь налаживается, всё хорошо и отлично, пока непроисходят непредвиденное. Акацуки стали действовать, они послали двоих членов организации на поимку Сюкаку. Им это удалось, но...(Тут начинаются изменения) коноховцев известили раньше и те поспели на помощь. Когда они прибыли, то почти всё было разрушено, Канкуро был отравлен ядом и у него оставалось ДВА дня. Сакура выличила его и всё было как по маслу, позвав бабулю Тиё которая хотела повидаться с внуком, четвёрка шиноби отправилась в путь. Они догнали Сасори и Дейдару ещё в лесу и тут началась бойня, Дей решил поймать сразу двоих и увёл Наруто с Какаши за собой, асори же остался сражаться с Сакурой и Тиё. Да Сакура и тиё победили, но бабуля заметила как он открылся под последнюю атаку, она оттдала жизнь чтобы оживить кукольника. Тот стал человеком и ушёл с поля боя даже непосматрев на Тиё, Сакура хотела бы его побить но сдерживалась из за обещания. Дейдара проиграл Наруто и Какаши, те забрали Гаару и пошли к Сакуре и Тиё. Дальше как по аниме, они пошли в Суну похоронили Тиё, Гаара жив и бла бла бла.
Вскоре происходят немалые перемены, Саске Учиха который всё это время тренеровался у Орочимару, понял что любит своего брата даже после того как тот перерезал всю семью, обломав планы Орочи он отправляется в Коноху и попросив прощения, остаётся там. В организации происходят невиданые события, Сасори став человеком задумывается что он вообще тут делает? Зачем ему всё это? Так и непоняв, вместе с Дейдарой они покидают организацию и идут в Суну. Много времени Сасори разговаривал с членами совета и Гаарой которые эти двое выкрали, но пятый казекаге не стал противиться и разрешил этой парочке жить в Суне. Итачи который всё это время был шпионом Конохи тож покидает организацию и отправляется в Коноху. Хотя на этом ничего незаканчивается, а продолжается, остальные члены организации тоже решают уйти но Лидер нехочет их так просто отпускать, взбесившись он призывает статую где заточенны 5 демонов. Некомата, Ёнби, Гоби, Хачимата и Рокуби. Они вырвались из заточения и заставили акацук покинуть уже разрушенную пещеру. Куда пошли они ни кто пока незнал, а пять демонов заключили между собой договор и пошли в разные деревни. Некомата пошла в страну огня, там был тот самый лес смерти где жил этот питомец бога, Рокуби ушёл в страну облака и поселился в огромной пещере. Гоби пошёл в страну огня вместе с Некоматой, Ёнби ушёл в страну земли и поселился около вулкана. А Хачимата уполз в страну рисовых полей поселившись около водопада. Эти чудовища ни кого нещадят но и не нападают на деревни. Что будет дальше придумайте сами.